流程性组织和职能性组织是目前在企业管理领域里边。被广泛讨论的两个组织概念。流程性组织和职能性组织主要有以下四个方面的区别。

第一个方面，在关注的焦点上面。流程性组织关注的是客户，是以客户为导向，通过流程的设计来解决客户的价值主张的实现问题。而职能性组织，它关注的是领导，是以领导为中心，通过领导来协调跨部门的运作问题。

第二个方面，就是在组织结构方面。流程性组织强调的是跨部门的项目团队的协作，强调的是组织架构的扁平化运作。而职能性组织，它是以金字塔结构为特征部门，强调部门凌驾于项目团队之上。通常是资源池部门的经理拥有对资源的支配权，甚至对项目方向的决策权。

第三个方面，在内部协调运作这个方面。流程性组织强调的是通过流程来解决端到端的内部的项目的运作，来实现管理的闭环。而职能性组织他是铁路警察，各管一段，各个部门为政，通过部门的领导来协调各种关系。

第四个方面，就是在管理理念方面的区别。流程性组织关注的是法制，关注的是透明，关注的是制度流程的标准化建设。而职能性组织关注的是人制，关注的是灰色。灰色管理就内部有很多不透明的地方。所以职能性组织的领导更加希望他拥有对很多事情和工作标准的解释权。